Tema pokok penelitian dan pengembangan yang sesuai dengan visi misi UPNVJ,
FKUPNVJ serta Renstra yaitu : Menuju Fakultas Kedokteran yang inovatif, unggul, dan
berdaya saing yang beridentitas bela negara tahun 2025. Bela Negara dapat dilakukan
secara fisik dan non-fisik. Bela Negara adalah sikap dan perilaku warga negara yg dijiwai
kecintaannya kpd NKRI yg berdasarkan Pancasila dan UUD 1945 dlm menjalin kelangsungan
hidup bangsa dan negara seutuhnya. Dalam kaitannya dengan bidang kesehatan, dapat diartikan
sebagai usaha menjaga bangsa serta kedaulatan negara melalui proses peningkatan
nasionalisme, serta menumbuhkan keaktifan dlm berperan utk mewujudkan kemajuan bangsa
dan negara di bidang sistim kesehatan untuk pertahanan negara.
Kegiatan penelitian di FKUPNVJ memiliki nilai-nilai Bela Negara, yaitu Cinta tanah
air, Sadar berbangsa & bernegara, Yakin kpd Pancasila, Rela berkorban dan Memiliki
kemampuan awal secara psikis dan fisik dalam teknologi kesehatan dan kedokteran untuk
mewujudkan ketahanan negara. Akademisi, dosen, dan mahasiswa merupakan salah satu
komponen pendukung bela negara yang wajib untuk diperkuat.
Fakultas Kedokteran UPNVJ mengambil 1 bidang unggulan yg sesuai dg ilmu
kedokteran yaitu kesehatan dan obat, yang terbagi lagi menjadi 12 isu strategis. Isu-isu
strategis itu dipilih berdasarkan kebutuhan di Indonesia. Salah satu isu strategis yang tercakup
di dalamnya adalah kedokteran matra yang memiliki fokus untuk manajemen kebencanan,
seperti yang tertuang di dalam misi FKUPNVJ. Matra didefinisikan sebagai Upaya Bela
Negara yg dilaksanakan dalam kegiatan Tridharma FK UPNVJ, yang merupakan
upaya ikut serta mewujudkan kemajuan bangsa dan negara serta mendukung program
pemerintah di bidang kesehatan sehingga mampu mengatasi hambatan, tantangan,
ancaman dan gangguan thd kedaulatan NKRI. Penetapan penelitian unggulan ini dg
mempertimbangkan kesiapan sumber daya manusia dan fasilitas penelitian / pengembangan,
serta rekam jejak (track record) penelitian yang jelas dan berkesinambungan pd setiap
kelompok peneliti yg ada di FK UPNVJ.
Hasil publikasi FKUPNVJ masih belum stabil pertahunnya. Hal ini menunjukkan
bahwa jumlah publikasi harus lebih ditingkatkan untuk ke depannya. Hal yang perlu
diperhatikan lagi adalah belum adanya HAKI yang dihasilkan dari para dosen-dosen, hal ini
harus lebih ditingkatkan terutama untuk meningkatkan kualitas dari para dosen di FKUPNVJ.